湖南省疾病預(yù)防控制中心成立于2001年3月9日，由原湖南省衛(wèi)生防疫站、湖南省健康教育所（2012年劃歸省衛(wèi)生計生委衛(wèi)生宣傳教育信息中心）、湖南省皮膚病防治研究所三家單位合并重組而成，隸屬于湖南省衛(wèi)生健康委，是行使政府疾病預(yù)防控制、公共衛(wèi)生技術(shù)管理與服務(wù)職能的公益一類專業(yè)機(jī)構(gòu)，承擔(dān)著除職業(yè)病、結(jié)核病和血吸蟲病防控以外的疾病防控任務(wù)。其使命是通過對疾病、殘疾和傷害的預(yù)防控制，創(chuàng)造健康環(huán)境，維護(hù)社會穩(wěn)定，促進(jìn)人民健康；其宗旨是以科研為依托、以人才為根本、以業(yè)務(wù)為中心；其口號是科學(xué)防病、規(guī)范檢測、公正誠信、促進(jìn)健康。

中心總部位于長沙市芙蓉中路一段450號，占地面積12.8畝，業(yè)務(wù)用房面積21744M2，固定資產(chǎn)1.62億元。人員編制336個，專業(yè)技術(shù)人員占85%以上。下設(shè)傳染病預(yù)防控制科、慢性非傳染性疾病預(yù)防控制科、免疫規(guī)劃科、疫苗臨床研究中心、突發(fā)公共衛(wèi)生事件應(yīng)急處置辦公室、性病艾滋病預(yù)防控制科、環(huán)境健康監(jiān)測科、學(xué)校衛(wèi)生科、食品安全監(jiān)測科、微生物檢驗科、理化檢驗科、毒理檢驗科、消毒檢驗科、地方病寄生蟲病預(yù)防控制科、預(yù)防醫(yī)學(xué)門診部、麻風(fēng)病防治科、病媒生物控制科等業(yè)務(wù)科室。

中心始終秉承質(zhì)量為先、服務(wù)至上的理念，狠抓實驗室質(zhì)量管理，先后獲國家實驗室認(rèn)可、國家資質(zhì)認(rèn)定、ISO9001質(zhì)量管理體系認(rèn)證等國家級認(rèn)定資質(zhì)9個，建有保健食品功能學(xué)檢驗與評價實驗室、流感監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)實驗室、實驗動物質(zhì)量檢測實驗室、瘧疾診斷參比實驗室等國家和省級實驗室10個。擁有科技部“省部共建國家重點實驗室培育基地”、省科技廳“湖南省微生物分子生物學(xué)重點實驗室”、省衛(wèi)生健康委“湖南省新發(fā)傳染病防控研究中心”、省教育廳“湖南省研究生培養(yǎng)創(chuàng)新基地”等科研平臺。對外掛牌湖南省食品安全風(fēng)險監(jiān)測評估中心、湖南省公共衛(wèi)生檢測檢驗中心、湖南省新發(fā)傳染病防控中心，是中南大學(xué)、南華大學(xué)等多所大學(xué)的研究生培養(yǎng)和教學(xué)基地。

中心始終堅持貫徹“預(yù)防為主”的衛(wèi)生工作方針，以促進(jìn)和保護(hù)人民健康為目標(biāo)，促進(jìn)基本公共衛(wèi)生服務(wù)均等化，不斷提高疾病預(yù)防控制能力、實驗室檢驗檢測能力、科研培訓(xùn)能力，形成了涵蓋傳染病防控、慢性病防控和公共衛(wèi)生監(jiān)測三大業(yè)務(wù)單元的疾病防控體系，為降低群眾疾病風(fēng)險、促進(jìn)經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展做出了貢獻(xiàn)。先后獲得“全國疾病預(yù)防控制工作先進(jìn)集體”“全國醫(yī)藥衛(wèi)生系統(tǒng)先進(jìn)集體”“全國衛(wèi)生應(yīng)急先進(jìn)單位”“全國防治非典型肺炎工作先進(jìn)基層黨組織”“全國愛國衛(wèi)生運(yùn)動60周年先進(jìn)集體”“全國五一巾幗標(biāo)兵崗”“全國公共機(jī)構(gòu)節(jié)能示范單位”“湖南省省級文明單位”“湖南省首批黨建示范點”“全國文明單位”“湖南省抗擊新冠肺炎疫情先進(jìn)集體”“湖南省抗擊新冠肺炎疫情全國三八紅旗手（集體）”“湖南省新冠肺炎疫情防控醫(yī)師團(tuán)隊先進(jìn)集體”等榮譽(yù)稱號。